После успешной, во всех смыслах, второй части Silent Hill началась работа по производству триквела. Первый трейлер игры был показан на E3-2002 (Electronic Entertainment Expo) и не прошло года, как проект добрался до прилавок игровых магазинов.
Первый же сюрприз поджидал игрока в самом начале и касался он главного героя, точнее героини. А впервые в истории Silent Hill нам придётся играть за женского персонажа — молодую девушку по имени Хизер.
Она непонятно каким образом оказывается в парке развлечений Lakeside, вокруг ржавчина, монстры, а в руках у героини нож. Не зная что делать дальше, она отправляется исследовать локацию, забирается на аттракцион Американские горки и её сбивает вагонетка…
После этого Хизер просыпается в забегаловке. Всё это было лишь в её сне. Она звонит своему отцу и говорит, что собирается ехать домой. Её нагоняет частный детектив Дуглас Картланд и говорит, что у него есть важная информация о её рождении. Девушка не желает его слушать и скрывается от него в женском туалете. Вылезает в окно и решает продолжить путь домой. Вновь вернувшись в торговый цент, в одном из торговых центров ей встречается монстр, который пожирает человеческий труп. Хизер хватает лежащий на полу пистолет и в приступе паники всаживает в создание целую обойму.
Вскоре героиня встретит босоногую девушку по имени Клаудия Вульф. Та просит, чтобы Хизер вспомнила свою истинную сущность и тогда новый Рай возродится на Земле. После этого Клаудия удаляется, а героиня продолжает свой путь по торговому центру.
По ходу игры Хизер встретится ещё один персонаж: Винсент Смит, который знает о героине больше, чем должен. В диалоге с ним впервые упоминается имя отца Хизер — Гарри.
Это один из главных поворотов третьего Silent Hill. На самом деле Хизер никто иная, как Шерон или Аллеса. Та самая девочка, которую главный герой первой части увёз из города 17 лет назад.
Со смертью Далии культ не прекратил своё существование. Его возглавила Клаудия и организовала поиски Алессы, чтобы с помощью неё возродить Бога.
Героиня решает отправится в Сайлент Хилл и отомстить Клаудии за то, что на убила её отца.
По дороге в Сайлент Хилл Хизер рассказыват Дугласу о своём прошлом. По факту это краткий пересказ первой части игры.
По прибытию в город, Хизер отправляется в больницу, чтобы встретится там с Леонардом, отцом Клаудии. при встрече девушка убивает Леонарда и забирает печать Метатрона, который может предотвратить рождение Бога.
Когда героиня добирается до церковного святилища, она становится свидетелем спора между Винсентом и Клаудией, в конце которого первый получает удар ножом в спину.
Клаудия объясняет, что Бог мог родиться только через боль, страдание и гнев, который бы испытал его носитель, коим является Хизер. Со смертью отца эти чувства в ней достигли апогея. Героиня пытается использовать печать Метатрона, чтобы остановить этот процесс, но этот артефакт ничем не может помочь.
Хизер вспоминает про кулон, который ей подарил отец. Внутри содержится вещество с помощью которого Гарри Мэйсон семнадцать лет назад смог победить Бога. Героиня съедает его и в результате отрыгивает эмбрион ещё не родившегося Бога. Клаудия хватает зародыша и проглатывает его, чтобы тот мог использовать её, как сосуд для своего рождения.
В результате Клаудия умирает, а на свет появляется не до конца сформировавшееся тело Бога с лицом, очень походим на Алессу. Наступает время финальной битвы.
В игре Silent Hill три концовки, но при первом прохождении остальные два недоступны. После победы над финальным боссом Хизер возвращается в парк аттракционов и встречается с Дугласам. Тот спрашивает, закончилось ли всё, однако героиня говорит, что нет, ведь он ещё жив и направляется на него с ножом, в последний момент превращая всё это в шутку.
Хизер просит не называть её так, ведь она теперь Шерил. такое имя дал ей отец много лет назад.
Вторая концовка начинается с того, что Хизер сжимает в руках нож, с которого капает кровь, а Дуглас лежит на земле мёртвый. Возможно этот финал от части иллюстрирует пророчество, которое звучало в течение игры: «С окровавленными руками ведущая верующих в Рай».
Для того, чтобы открыть такую концовку необходимо пройти игру минимум два раза и набрать 4000 очков. Узнать сколько очков уже набрал игрок нельзя, поскольку счётчика нигде нет.
Существовала ещё одна, ни совсем официальная концовка. Если вовремя не принять таблетку Аглаофотиса, то Хизер родит Бога. Для этого даже сделали специальную заставку. Однако, после неё не будет никаких титров, а лишь надпись Game Over.
Наконец, третья концовка. Она, как и водится в Silent Hill, шуточная и связанная с инопланетянами. Чтобы получить её необходимо убить 30 монстров определённым бонусным оружием.
Как признался Масахиро Ито, образ финального босса ему дался очень не легко. На его создание он потратил больше времени, чем на любого другого противника.
Раннее невиданный графический эффект создавал натуральные динамичные структуры, чем изрядно шокировал игроков. Точно так же обстояло дело и с монстрами. Их в этот раз было довольно много, да и в целом динамика битв стала больше зрелищной.
На смену расслабленным и меланхоличным мелодиям пришли бодрые и куда более быстрые композиции. На этот раз Акира Ямаока пошёл ещё дальше и добавил к своим композициям ещё и вокал. Он специально ездил в Америку и устраивал там прослушивание, чтобы подобрать необходимый тембр голоса. Из нескольких десятков участниц его выбор остановился на Мэри Элизабет МакГлинн, с которой Акира продолжил сотрудничество во всех последующих играх серии.
Впервые в серии игра начиналась не в Сайлент Хилле, а совершенно в другом месте. Только во второй половине героиня приезжала в туманный город.
Символом третьей части можно назвать Робби — игрушечного кролика огромных размеров, встречающегося то тут, то там.
Третья часть являлась не только прямым сиквелом первой, но и была сильно похожа на неё по структуре и сюжету, а именно: начиналась они обе в потустороннем мире, под конец которого игрок погибал и просыпался в закусочной и встречал представителя закона. В торговом центре оба натыкались на плохо работающие телевизоры, на котором появлялось изображение Шерил. Главные антагонистки ставили перед собой задачу возродить некое божество.
Третья часть вышла в мае 2003 года на Playstation 2 и через полгода была импортирована на PC. В 2012 году Konami выпустила в свет Silent Hill HD Collection.
Как и прошлая часть, Silent Hill 3 получила отличные отзывы от критиков и игроков.